sci-biology/amap/files/amap-2.2-cxxflags.patch


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diff -Naur amap-align.old/align/Makefile amap-align/align/Makefile
--- amap-align.old/align/Makefile	2008-02-13 19:36:31.000000000 -0500
+++ amap-align/align/Makefile	2008-04-17 13:22:17.000000000 -0400
@@ -15,6 +15,8 @@
 #    c) RELEASE mode
 ################################################################################
 
+OPT_CXXFLAGS = -O3 -W -Wall -pedantic -funroll-loops
+
 OTHERFLAGS = -DNumInsertStates=1 -DVERSION='"AMAP.2.2"'
 
 # debug mode    
@@ -26,8 +28,7 @@
 
 # release mode
 #CXXFLAGS = -O3 -W -Wall -pedantic -DNDEBUG $(OTHERFLAGS) -mmmx -msse -msse2 -mfpmath=sse -march=pentium4 -mcpu=pentium4 -funroll-loops -fomit-frame-pointer 
-CXXFLAGS = -O3 -W -Wall -pedantic -DNDEBUG $(OTHERFLAGS) -funroll-loops
-
+CXXFLAGS = $(OPT_CXXFLAGS) -DNDEBUG $(OTHERFLAGS)
 ################################################################################
 # 3) Dependencies
 ################################################################################